雪の降り積もる北国を舞台にした3Dアクションパズルゲーム。30あるステージごとに与えられるミッションをクリアしていく。「アヒルくんウォーズ北国編」は、アクションゲームにブロック押しパズルの要素をほどよく組み合わせたゲーム。プレイヤーは主人公のアヒルくんを操作し、「全ての敵を倒せ」「ギャルを救出せよ」といった各ステージごとに設定されるミッションをクリアする。美しい3Dグラフィック、かわいらしいデザインのキャラが印象的。
アヒルくんの武器は雪玉。敵の攻撃もまた雪玉で、つまりは雪合戦をベースにミッションが展開されていく。ともに相手の雪玉が当たるとダメージを受け、ライフゲージが空になったところで倒される。敵との接触ではダメージを受けることはない。アヒルくんのライフがゼロになるとゲームオーバーとなる。
アヒルくんの攻撃では、着弾目標点であるターゲットサイトが示され、敵がターゲットサイトに入ったときには緑色で縁取り表示されるので、正確な攻撃を行うことが可能だ。攻撃のためのアイテムとして、一定時間雪玉の威力を増す「パワーショット」とライフゲージを一定量回復させる「ライフ30」がある。
パズルゲームの側面を与えているのが、ブロックやスイッチなどのアイテム。ステージによっては、フィールドに押して動かすことのできる「アイスブロック」や、スイッチによって上下に動く「ムーヴィングアイスブロック」といった特殊ブロックが置かれている。ミッションをクリアするためには、これらのブロックやスイッチをうまく使って、目的の場所に移動したり、宝箱を手の届く位置に動かしたりする必要がある。
ゲーム中に視点を変更することが可能。開始時に設定されている斜め上方からの「ノーマル視点」のほか、ステージを真上から見る「上空固定視点」、主人公の視点そのままの「アヒルくん視点」があり、任意に切り替えられる。
ステージをクリアすると次のステージに進むが、このときクリアしたステージをセーブする/しないは、そのつど指定できる。また、挑戦中のステージとクリアしたステージを練習できる「PRACTICE」モードがあり、すでにクリアしたステージも自由に再挑戦して楽しめる。